from PhD import * 💻

Ещё позвольте поворчать. 🥺На днях также расфорсилась работа, в которой учёные решили разобраться в какую сторону кошки сворачиваются в клубок во время сна (спойлер: чаще в левую), и в чем причина такого явления (спойлер 2: позволяет более внимательно относиться к внешним угрозам в силу ассиметрии мозга). 🦈Но кажется тут случился классический мем про учёного изнасиловавшего журналиста. 📍Авторы утверждают лишь факт 266 левосторонних клубков против 142 правосторонних. Дальнейший вывод, который растащили по новостям - лишь идея занимающая 1 (одно!) предложение в дискуссии, не подкреплённая вообще больше ничем. Ни каким анализом, ни ссылочкой. Сама по себе работа всего лишь Correspondence, а не полноценная статья. Так что ноль претензий к авторам. Но обидно что она так расфорсилась, и люди стали утверждать как факт совершенно мимолётный умозрительный вброс. У той же группы есть полноценные и более заслуживающие внимание публикации: наличие левшей/правшей у кошек собак и мышей, насколько хозяева собак замечают изменения в поведении питомцов связанные с болью, почему коты зарапают своих хозяев и т.д.😉Линк: https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(25)00507-X

И на нашей улице случился DeepMind 😫.Недавно писал тут что играюсь с каким-то машин-лернингом в омиксном контексте. И вот уже сутки как вся область кипит от обсуждений новой гугловской модели - AlphaGenome. Условно говоря, предсказывают "всё" с разрешением вплоть до 1bp. Вот оказывается, что чувствовали структурщики в день выхода АльфаФолда. Хотя в моем случае наоборот всё здорово - я сам нейросетки не собираю, но пытаюсь извлечь какую-то пользу из уже имеющихся. Так что мне AlphaGenome вообще кстати. Дома не ждите, ушел читать 100-страничный препринт 👀

Открываем третий сезон цикла лекций «Личный путь в сеньора биоинформатика» встречей с Никитой Ваулиным. 🔬 Никита - биоинформатик и преподаватель программирования для биологов в ВШЭ и Институте биоинформатики, сейчас PhD-студент в группе Игоря Адамейко в Вене, где изучает механизмы принятия клеточных решений (cell fate decisions). Закончил биофизику в питерском Политехе и магистратуру Сколтеха. Фанат Hi-C и 3D-геномики в целом. Мы пригласили Никиту рассказать, как ему дается обучение в Вене и о чем там мечтают биоинформатики.Начало эфира 25 июня в 19:00 по Мск. Трансляции проходят в рамках курса «Машинное обучение в биологии и биомедицине» от OpenBio.До старта программы еще далеко, но уже можно записаться по минимальной цене ↗️На встрече мы обсудим детали карьерного трека Никиты, лайфхаки поступления на PhD, тренды отрасли и образования в области биоинформатики и многое другое.✔️ Зарегистрируйтесь, чтобы не пропустить напоминание о прямой трансляции и получить запись встречи. ❔ Задавайте вопросы спикеру в комментариях к этому посту, чтобы мы могли их озвучить.Увидимся на эфире!#openbio_career #openbio_webinar #openbio_interview 📌 Машинное обучение в биологии и биомедицине | OpenBio.Edu — подписывайтесь!

Сегодня сделал себе МРТ 🐸У нас все еще идет ротация, сейчас у нас блок про Magnetic Resonance and Brain Stimulation 🧠. Во-первых, по 3 часа по утрам обсуждали физические принципы лежащие в основе - очень приятно было половить флешбеки из моего биофизического бакалавриата. А во-вторых, сегодня в качестве завершения этого блока нам дали поработать на МРТ-аппарате мощностью 3 Тесла ⚡️. В качестве объекта исследования были мы сами, 4 волонтера из группы, и я оказался первым в их числе. Мне сделали T1 МРТ, коллегам Т2, Proton density и фМРТ. Теперь точно могу сказать, что чернила в моих татуировках не содержат металла 😁. Ну и в остальном все тоже в порядке - никаких патологий (good to know после того как нам дали потрогать менингиому месяц назад), анатомия "как из учебников". Мозолистое тело чуть покороче чем у коллег, зато мозжечок большой.

Цвентендорфская АЭС - наверное, самый дорогой в мире памятник предубеждениям одних и некоммуникативности других. Полностью построенная, наполненная оборудованием и персоналом так и не была введена в эксплуатацию. В 1978 году был проведён референдум, в результате которого в Австрии был введён запрет на всю ядерную энергетику, и к бесчисленным средствам потраченным на строительство АЭС добавились ещё - на еë (уже вечную) консервацию. Во многом причина была не только в страхах людей (n.b. до Чернобыля ещё 8 лет), а в недовольстве правительством. Мирный атом проиграл в Австрии с результатом в 49.53% против 50.47% голосов. Теперь ЦАЭС - площадка для экскурсий, инженерных курсов и ночных рейвов. 🐰